2016年，對醫藥電商來說是復雜多變的一年，7月底8月初，天貓醫藥館等3家互聯網第三方藥品銷售平臺網上藥品零售試點被全部叫停，原本有望放開的網售處方藥因此再次變得撲朔迷離。一方面政策收緊，另一方面醫藥電商本身的增速放緩，擺在眼前的融資、盈利等現實問題，也都使得醫藥電商之路再次變得坎坷不平。5月18日,藥給力因為“融資和公司資金壓力”,1小時送藥上門業務停止。在整個醫藥電商領域，相對比較搶眼的O2O、B2C平臺，第三方B2B平臺因為本身的客戶群體及發展現狀，曝光率顯然要低一些，不過回顧2016到2017年初，不少第三方醫藥電商B2B平臺融資、對外合作的消息也頻頻見于各類媒體，在行業內也引發了不少的關注。
據不完全統計，商務部直報系統顯示2015年醫藥電商銷售總額達476億元，其中B2B銷售占比93%，B2C銷售僅占醫藥電商銷售總額的6.7%。而截止到2017年2月22日，據CFDA網站數據顯示：各級藥監部門頒發的《互聯網藥品交易服務資格證書》共有916張，其中B證224張、C證649張，A證獲得企業僅43家，可以看出，相對而言A證企業競爭態勢還遠遠不如C證企業那么激烈。正因為A證的稀缺性及整體市場規模，使得一些運營狀況不錯的A證企業在資本市場上往往能獲得不錯的估值，第三方醫藥B2B的平臺也對資本更具吸引力。
在醫藥市場上，傳統的批發采購模式弊端居多，例如流通環節中的信息不對稱、開票問題、回款周期長等問題一直以來都是這個行業普遍存在的痛點，正是基于這些問題，第三方醫藥電商B2B模式就應運而生。對于采購商來說，B2B醫藥平臺的價值在于平臺藥品種類齊全、價格透明、操作方便，信息傳遞更為高效，采購更便捷;對于上游供應商來說，B2B醫藥平臺使其營銷渠道管理更扁平化，營銷費用更低，同時還能享受互聯網帶來的規模效應，進一步提升產品銷量;一些有實力的平臺甚至能夠提供供應鏈金融服務，幫助上下游緩解資金壓力，給上下游企業解決實際問題。相比于傳統批發采購模式，醫藥電商B2B平臺更有發展前景及優勢。
但不可否認，醫藥電商B2B平臺在現階段也面臨不少問題，比如物流配送、質量監管等問題也是這類平臺不得不面臨的實際問題。但是相信隨著市場的日益成熟和用戶接受度的進一步提高，加上平臺自身的創新發展，這些問題將會迎刃而解，同時也會涌現出一些出類拔萃的企業。
就現階段而言，受制于國內醫藥電商的整體發展進程，雖然部分有前瞻意識的企業已經開始這方面的試水，一些工業企業早已經與部分醫藥B2B平臺展開合作，甚至有些生產、流通企業也成立自己的B2B電商平臺(多為B證)。但是畢竟在平臺運營方面的經驗和技術優勢不如A證平臺企業，而拿到A證的企業在基礎客戶量方面是沒有優勢的，這個時候平臺方和上游廠商開展商業合作，雙方優勢結合，上游借力于平臺方的運營經驗和專業技術優勢，平臺借力于上游的產品和基礎客戶量優勢，共同發展。
